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第七节核酸外切酶
1.核酸外(Exonucleases)切酶
定义:一类从多核苷酸链的一端开始按序催化降解核苷酸的酶。
分类:单链的核酸外切酶
双链的核酸外切酶
第八节核酸内切酶
1.S1核酸酶
(1)特点:
活性:降解单链核酸(DNA或RNA)为单核苷酸;降解双链核酸的单链区
(2)S1核酸酶的应用----RNA分子的定位
2.Bal31核酸酶
Bal31核酸酶的三种活性:
(1)单链核酸内切
(2)双链核酸外切
(3)双链切口对应链
Bal31核酸酶主要用途:
(1)诱发DNA发生缺失突变
(2)定位测定DNA片断中限制性位点的分布
(3)研究超盘旋DNA分子的二级结构
3.其他核酸酶
外切核酸酶Ⅲ(ExonucleaseⅢ):3’至5’外切
RNA酶Ⅰ(RNaseⅠ):切割DNA-RNA杂合链中的RNA
其他核酸酶:
外切核酸酶Ⅲ(ExonucleaseⅢ):3’至5’外切
DNA酶Ⅰ(DNaseⅠ):随机切割ss&dsDNA
RNA酶Ⅰ(RNaseⅠ):切割DNA-RNA杂合链中的RNA
第三章Techniques基因工程技术
Outline
1、电泳
2、分子杂交
3、转化与转染
4、核酸测序
5、DNA扩增---PCR
6、核酸-蛋白相互作用
第一节电泳
原理:通过电场的作用使带电的大分子在电泳介质中运动。
目的:根据带电分子的分子量、电荷及构型分离不同的分子(依据不同的凝胶体系)。
电泳的分类:
琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis),
聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE)
琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)
ds-DNA
目的:
分离不同长度的DNA片段
a.确定DNA片段的长度
b.确定DNA的有无与多少
c.分析酶切产物
凝胶电泳的原理:略
电泳步骤
第一步:制胶
第二步:样品制备
第三步:点样
第四步:跑电泳
第五步:紫外灯下检测,拍照
第六步:数据处理
缓冲体系:
TAE,pH 8.0,~50 mM-Tris,Acetate,EDTA
TBE,pH 8.0,~50 mM-Tris,Borate,EDTA
影响迁移率的因素:
凝胶的孔径
电压
DNA片段长度及结构
EB的影响
分辨率影响因素:
琼脂糖浓度
缓冲液或样品的盐离子浓度
核酸上样量
电压
聚丙烯酰胺凝胶电泳(poly-acrylamide gel electrophoresis,PAGE)
范围:短片段分辨率:1bp
类型:
变性胶(长度)、
非变性胶(长度、构型)
变性胶:1、含尿素;2、DNA样品经甲酰胺与热处理;3、电泳保持温度。
Agarose与PAGE的不同:
分辨率
操作
应用:RFLP,AFLP,DD-PCR,sequencing,primer extension,S1 mapping,RNase protection assay…
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